多肽(Peptide)是指生物活体中器官、组织、体液及细胞内全部的内源性多肽组分,同时也包括蛋白质降解产生的或者具有特定活性的多肽,通常指的是含有2到50个氨基酸的多肽。多肽是在人体生理和病理中发挥重要作用的重要分子,在机体的生长发育和新陈代谢过程中起重要的调控作用,因此广泛应用在生物标志物的筛选、疾病诊断与检测、植物生长发育调控和食品等方面。
采用有机溶剂共沉淀和酸辅助再溶解方式提取生物多肽。使用tims TOF HT 4D-DDA 质谱检测技术进行高通量的蛋白质组学检测。质谱原始文件进行de novo和基于数据库的搜库分析,并对数据进行质量控制、肽段理化性质统计、差异肽段筛选和功能富集分析等。
筛选疾病相关的特征肽段,开发疾病早筛早诊的标志物
筛选疾病关键肽段导致疾病发生发展的机制研究
筛选入药动植物的活性肽段
通过食品中特殊肽评价食品加工工艺和食品安全
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预测肽段活性:一来可以验证搜库的准确性,二来可以将之与相关前体蛋白生物活性的结构域相匹配,从而预测其在前体蛋白中的定位和功能。
基于功能肽库对肽段注释:功能肽是在体内担负着重要调节功能的肽类物质,与生命体的生长、代谢、免疫、信号传导等生理活动息息相关。通过功能肽库注释帮助发现样本中的功能肽段。
蛋白质从头测序技术(De Novo Sequencing)是利用串联质谱(MS/MS)获取离子,根据两个片段离子之间的质量差来计算肽链上氨基酸残基的质量,从而得到蛋白的氨基酸序列的分析过程。De novo分析的优势在于不需要依赖任何数据库,就可对已知蛋白或未知蛋白进行序列分析。
参考多篇文献总结并测试出最优多肽提取方案。
提取效率高,鉴定深度高,助力新肽的发现
共计完成项目100+
完成物种类型30+
合作单位40+
发表期刊:Theranostics
影响因子:12.4
发表单位:浙江大学
发表时间:2023.05.21
样本类型 | 样本来源 | 送样量 |
动物组织 | 常规组织(脑、心、肝、肺、肾、肌肉等柔软组织) | 50mg |
坚硬组织(软骨、毛发) | ||
植物组织 | 柔软组织(木本植物的也、花等,草本植物,藻类,蕨类植物) | 500mg |
坚硬组织(根、树皮、树枝,果实种子等) | / | |
微生物 | 常见细菌、真菌菌体(菌体沉淀) | 200μL |
细胞 | 悬浮/贴壁培养细胞(细胞计数/沉淀) | 107 |
液体类 | 血浆/血清/脑脊液 | 100μL |