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CHARACTERISTIC

技术特点




MHC抗体富集MHC及其结合肽,使用高深度质谱仪tims TOF HT进行检测。随后采用Deep novo深度测序技术,通过连续迭代预测氨基酸,从而从串联质谱(MS/MS)数据中重建多肽序列。不需要序列数据库,因此可以从质谱数据中预测未知多肽的氨基酸序列,有助于发现新抗原、开发疫苗以及推进癌症免疫治疗。

APPLICATIONS

应用方向

ADVANTAGES

服务优势

高分辨率质谱timsTOF HT助力

国内首装高分辨率的timsTOF HT质谱仪整合了第四代超高离子容量的TIMS-XR分析器和更先进的数字转换技术。新的设计为无与伦比的蛋白质组学分析深度和高通量定量分析提供了更宽的动态范围。能够在细胞和组织的定量蛋白质组学分析中,实现更高的蛋白覆盖深度。

De novo全面鉴定

Deep Novo是一种基于深度学习的从头测序算法,通过连续迭代预测氨基酸从而预测MS/MS扫描的肽段。在每一步,Deep Novo预测下一个氨基酸和它的分数。得分代表某个特定氨基酸出现在氨基酸测序内某个位置的概率。然后计算预测肽的得分作为其氨基酸得分的平均值。这种新工具可以提高氨基酸和其水平的准确性。


鉴定非经典肽

分析内容能够将新序肽段测序结果与数据库搜索结果相结合。新序肽段序列与蛋白质数据库条目对齐,提供有关翻译后修饰、突变、同源肽段和新肽段的额外信息。


高效遴选天然呈递免疫肽

基于免疫亲和力纯化以及高效液相色谱-质谱联用(HPLC-MS/MS)的方法,通过大规模免疫肽组学能揭示人类蛋白质组中的热点区域,这类热点区域与肽表位有更好的识别与结合能力,包括识别突变衍生的新表位,从而治疗基因突变性肿瘤,实现个体化精准治疗。

  • 高分辨率质谱timsTOF HT助力

  • De novo全面鉴定

  • 鉴定非经典肽

  • 高效遴选天然呈递免疫肽

ANALYSIS PROCESS

分析流程

免疫肽组学分析流程

RESULT DISPLAY

结果展示

免疫肽组结果展示

CLASSIC CASES

经典案例

甲型流感病毒MHC-I类T细胞表位的鉴定

发表期刊:Emerging Microbes & Infections
影响因子:8.4
发表单位:德国图宾根大学
发表时间:2024.02.08

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免疫肽组学助力间皮瘤免疫疗法的开发

发表期刊:Nature Communications
影响因子:14.7
发表单位:芬兰赫尔辛基大学药学院
发表时间:2023.11.03

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SAMPLE REQUIREMENTS

样本要求

内容种属样本类型
HLA分型人和鼠(MHC-I型)骨髓或者外周血:体积≥2 mL,白细胞计数(3.50~9.50)×10^9/L;EDTA或枸橼酸钠抗凝,不可用肝素抗凝剂。
免疫肽组分析人和鼠(MHC-I型)

细胞:2*108;

组织:200mg


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